Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfia1B2RXQ2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms