Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp26c1B2RXA7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms