Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clrn2B2RVW2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clrn2B2RVW2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms