Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf518aB2RRF6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf518aB2RRF6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf518aB2RRF6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms