Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Uhrf1bp1B2KF50 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Uhrf1bp1B2KF50 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms