Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brpf3B2KF05 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brpf3B2KF05 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms