Protein–RNA interactions for Protein: B1AX30

1700031F05Rik, MCG116637, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700031F05RikB1AX30 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700031F05RikB1AX30 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700031F05RikB1AX30 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700031F05RikB1AX30 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700031F05RikB1AX30 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700031F05RikB1AX30 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700031F05RikB1AX30 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1700031F05RikB1AX30 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700031F05RikB1AX30 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700031F05RikB1AX30 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1700031F05RikB1AX30 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700031F05RikB1AX30 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700031F05RikB1AX30 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700031F05RikB1AX30 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700031F05RikB1AX30 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700031F05RikB1AX30 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700031F05RikB1AX30 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700031F05RikB1AX30 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700031F05RikB1AX30 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700031F05RikB1AX30 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700031F05RikB1AX30 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms