Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtpruB1AUH1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtpruB1AUH1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
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