Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms