Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttll11A4Q9F4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttll11A4Q9F4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttll11A4Q9F4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttll11A4Q9F4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttll11A4Q9F4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttll11A4Q9F4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ttll11A4Q9F4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttll11A4Q9F4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttll11A4Q9F4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttll11A4Q9F4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttll11A4Q9F4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttll11A4Q9F4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttll11A4Q9F4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttll11A4Q9F4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttll11A4Q9F4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttll11A4Q9F4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttll11A4Q9F4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttll11A4Q9F4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms