Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odf2A3KGV1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms