Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc9bA3KGF9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc9bA3KGF9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms