Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samt1A2BED8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Samt1A2BED8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Samt1A2BED8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Samt1A2BED8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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Samt1A2BED8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Samt1A2BED8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Samt1A2BED8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Samt1A2BED8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Samt1A2BED8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Samt1A2BED8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Samt1A2BED8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Samt1A2BED8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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