Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Scn3aA2ASI5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scn3aA2ASI5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn3aA2ASI5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms