Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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