Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syndig1A2ANU3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syndig1A2ANU3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms