Protein–RNA interactions for Protein: A2ALW2

Zkscan16, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 16, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan16A2ALW2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zkscan16A2ALW2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zkscan16A2ALW2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Zkscan16A2ALW2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan16A2ALW2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan16A2ALW2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan16A2ALW2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan16A2ALW2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan16A2ALW2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zkscan16A2ALW2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms