Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SetxA2AKX3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms