Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn34dA2AGU5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cldn34dA2AGU5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cldn34dA2AGU5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cldn34dA2AGU5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cldn34dA2AGU5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34dA2AGU5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms