Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc163A2AGD7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc163A2AGD7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc163A2AGD7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms