Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C87977A2A958 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C87977A2A958 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C87977A2A958 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C87977A2A958 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C87977A2A958 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87977A2A958 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87977A2A958 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87977A2A958 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C87977A2A958 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C87977A2A958 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C87977A2A958 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C87977A2A958 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C87977A2A958 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C87977A2A958 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms