Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prdm16A2A935 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prdm16A2A935 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prdm16A2A935 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prdm16A2A935 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prdm16A2A935 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prdm16A2A935 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prdm16A2A935 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prdm16A2A935 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prdm16A2A935 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prdm16A2A935 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prdm16A2A935 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prdm16A2A935 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prdm16A2A935 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Prdm16A2A935 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Prdm16A2A935 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prdm16A2A935 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms