Protein–RNA interactions for Protein: A2A5R2

Arfgef2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef2A2A5R2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arfgef2A2A5R2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arfgef2A2A5R2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arfgef2A2A5R2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arfgef2A2A5R2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arfgef2A2A5R2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arfgef2A2A5R2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arfgef2A2A5R2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arfgef2A2A5R2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arfgef2A2A5R2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Arfgef2A2A5R2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arfgef2A2A5R2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arfgef2A2A5R2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arfgef2A2A5R2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arfgef2A2A5R2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms