Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms