Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms