Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RNP2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RNP2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms