Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

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Length 842 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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