Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms