Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csmd2V9GX34 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csmd2V9GX34 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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