Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Hdac5Q9Z2V6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hdac5Q9Z2V6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdac5Q9Z2V6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms