Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mtmr1Q9Z2C4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mtmr1Q9Z2C4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms