Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rlbp1Q9Z275 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms