Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccne2Q9Z238 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccne2Q9Z238 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne2Q9Z238 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms