Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trip6Q9Z1Y4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trip6Q9Z1Y4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trip6Q9Z1Y4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms