Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ap3b1Q9Z1T1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms