Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N7

Arid3b, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3bQ9Z1N7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid3bQ9Z1N7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Arid3bQ9Z1N7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid3bQ9Z1N7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid3bQ9Z1N7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid3bQ9Z1N7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid3bQ9Z1N7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid3bQ9Z1N7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid3bQ9Z1N7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid3bQ9Z1N7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arid3bQ9Z1N7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Arid3bQ9Z1N7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arid3bQ9Z1N7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arid3bQ9Z1N7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arid3bQ9Z1N7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms