Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J3

Nfs1, Cysteine desulfurase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfs1Q9Z1J3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfs1Q9Z1J3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfs1Q9Z1J3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms