Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nek4Q9Z1J2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek4Q9Z1J2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms