Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3bp5Q9Z131 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp5Q9Z131 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bp5Q9Z131 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bp5Q9Z131 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bp5Q9Z131 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bp5Q9Z131 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bp5Q9Z131 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5Q9Z131 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5Q9Z131 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5Q9Z131 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5Q9Z131 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5Q9Z131 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5Q9Z131 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5Q9Z131 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5Q9Z131 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5Q9Z131 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5Q9Z131 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5Q9Z131 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp5Q9Z131 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms