Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms