Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Skp2Q9Z0Z3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skp2Q9Z0Z3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms