Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itgb6Q9Z0T9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itgb6Q9Z0T9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Itgb6Q9Z0T9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itgb6Q9Z0T9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itgb6Q9Z0T9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itgb6Q9Z0T9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb6Q9Z0T9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb6Q9Z0T9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms