Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slfn1Q9Z0I7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slfn1Q9Z0I7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slfn1Q9Z0I7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slfn1Q9Z0I7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slfn1Q9Z0I7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slfn1Q9Z0I7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slfn1Q9Z0I7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slfn1Q9Z0I7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slfn1Q9Z0I7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slfn1Q9Z0I7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slfn1Q9Z0I7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slfn1Q9Z0I7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slfn1Q9Z0I7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slfn1Q9Z0I7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slfn1Q9Z0I7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn1Q9Z0I7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn1Q9Z0I7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn1Q9Z0I7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms