Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pmfbp1Q9WVQ0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pmfbp1Q9WVQ0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms