Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pacsin2Q9WVE8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacsin2Q9WVE8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms