Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slit3Q9WVB4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Slit3Q9WVB4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slit3Q9WVB4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms