Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ArcQ9WV31 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArcQ9WV31 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArcQ9WV31 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms