Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1a4Q9WV27 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a4Q9WV27 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms