Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srd5a3Q9WUP4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms