Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scnn1bQ9WU38 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scnn1bQ9WU38 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms